A lo largo de sus más de 50 años de trayectoria profesional, Manuel Alcántara ha obtenido numerosos premios y reconocimientos.
Como poeta, ha sido distinguido con los premios Antonio Machado, Nacional de Literatura, Hispanidad de Alforjas para la Poesía e Ibn Zaydún. Como articulista, ha recibido los tres máximos premios del periodismo español: el Luca de Tena, el Mariano de Cavia y el González-Ruano. Además, ha obtenido premios periodísticos como el Javier Bueno (de la Asociación de la Prensa de Madrid), el José María Pemán, el Pedro Antonio de Alarcón, el Bravo, el Costa del Sol, o el Joaquín Romero Murube, entre otros. Recibió el Premio de las Letras Andaluzas Elio Antonio de Nebrija y fue nombrado Autor del año (2019) por el Centro Andaluz de las Letras de la Junta de Andalucía.
A estos reconocimientos se unen otros de orden académico y social: Doctor Honoris Causa de la Universidad de Málaga, Académico de la Real Academia de Bellas Artes de San Telmo, Medalla de Andalucía, Encomienda de la Orden Civil de Alfonso X el sabio, Hijo Predilecto de Málaga, Hijo Predilecto de Málaga y de su provincia e Hijo Adoptivo del Rincón de la Victoria. Su nombre da título a un premio de poesía, a otro internacional de periodismo, y un tercero, nacional, de periodismo deportivo.
- 1962: Premio Nacional de Literatura, por Ciudad de entonces
- 1965: Premio de Periodismo Luca de Tena, por Pablo VI, en Harlem
- 1975: Premio de Periodismo Mariano de Cavia, por Federico Muelas
- 1978: Premio de Periodismo González-Ruano, por Tono
- 1979: Hijo Predilecto de Málaga
- 1984: Pregonero de la Semana Santa de Málaga
- 1987: Hijo Adoptivo del Rincón de la Victoria
- 1993: Creación del Premio Internacional de Poesía Manuel Alcántara
- 1995: Premio Mariano José de Larra
- 1999: Hijo Predilecto de la provincia de Málaga
- 1999: Creación del Premio Internacional de Periodismo Manuel Alcántara
- 1999: Premio José María Pemán, por Aniversario
- 2001: Medalla de Oro de Andalucía
- 2000: Doctor Honoris Causa de la Universidad de Málaga
- 2002: Medalla de Oro del Ateneo de Málaga
- 2005: Premio El Torreón de la Fundación Wellington
- 2005: Medalla de Honor al Malagueño del Siglo
- 2009: Premio Joaquín Romero Murube, por Cansinos vuelve a Sevilla
- 2010: Premio de las Letras Andaluzas Elio Antonio de Nebrija
- 2010: Homenaje a su obra poética en el Festival Internacional de Poesía en el Dickinson College de Pennsylvania
- 2011: Documental El pésimo actor mexicano
- 2017: ‘First Amendment Award 2017′ en reconocimiento a toda su carrera profesional (concedido por la Asociación Española de los Eisenhower Fellowships)
- 2017: Ingreso en la Orden Civil de Alfonso X el Sabio, con la categoría de Encomienda
- 2018: Creación del Premio Nacional de Periodismo Deportivo Manuel Alcántara (2018)
- 2018: Medalla de San Isidoro (Unión Nacional de Escritores de España)
- 2019: Autor del año por el Centro Andaluz de la letras (CAL)